转自： 酸谈（微信公众号）

曾经环状RNA(circRNA)是RNA领域的路人甲，不仅毫无存在感，甚至还被科研者认为是转录噪音。如今终于大放异彩、名声大噪，成为RNA领域的新生代“明星”，备受科研者追捧。

因而，本期《文献精读》课程中，解螺旋·Jenna老师选取了一篇发表于Cell期刊的综述《The Biogenesis, Functions, and Challenges of Circular RNAs》，细述circRNA的前世今生、惊天动地的功能以及必需熟知于心的研究套路。

其实，早在几十年前，关于circRNA的报道就已零星出现，但circRNA之所以长期呆在科研冷宫，是因为之前的技术以及科研知识贮备跟不上。

如今二代测序的蓬勃发展，让circRNA彻底走出冷宫，一展曼妙身姿：它不仅具有组织特异性，还能够通过不同途径影响基因表达，有效扩展真核细胞转录组多样性和复杂性。

circRNA是一类由mRNA前体经反向可变剪切(back-splicing)而来、共价闭合且保守的单链转录本，通过miRNA海绵功能、干扰可变剪切、结合蛋白等方式调控来源基因及线性mRNA 的表达。

课程中，先是重点拆解了circRNA的生物合成调节及机制，如RNA聚合酶II转录主导的后剪接链合机制、核心剪接体机制、顺式作用元件以及RNA结合蛋白机制。

由于circRNA不受核酸外切酶的影响，与线性RNA相比能更稳定地存在于人体内，因此即使不充足的表达也能够积累较高的丰度。

但一般来说，circRNA的表达水平却可以维持在较低水平，可见circRNA是通过其他途径进行降解，而其背后的机制仍尚不明确。

circRNA的分子特性决定了它们在转录和转录后的重要作用，也暗示着其可能作为疾病诊断的理想biomarker。

课程中详细介绍了circRNA与对应同源线性RNA剪切的影响，以及核内circRNA对细胞转录及剪接的作用。

同时课程也指出，circRNA可作为miRNA海绵，抑制miRNA与靶基因结合；也可通过与特定蛋白形成复合物，从而调节蛋白的表达及功能。

此外，最新研究也发现，circRNA还具有翻译蛋白的潜能，比如m6A修饰的circRNA被证明可以进行蛋白翻译。

最后，课程也介绍了circRNA研究的前沿方法，如全基因组预测、实验验证方法、功能获得与缺失的研究方法和显像技术，并指出这些方法的不足与局限。科研者可以针对课题研究需要，合理地选择合适的研究方法。

同时，课程也介绍了circRNA的实用研究套路分析，给同领域的科研者提供研究思路。