原创作者:
环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一类比较特殊的RNA,在上个世纪已经发现了它们的存在。但直到2013年以来,随着测序技术的深入应用,circRNA的研究才慢慢兴起 [1, 2]。circRNA往往会在神经相关的组织和细胞中有比较丰富的含量,因此可能会影响相关的一些生物学过程。
circRNAs在哺乳动物大脑中的丰度和功能已被越来越多的广泛关注,但是他们在大脑衰老中的生物学意义还是未知的。
文章题目 :Annotation and functional clustering of circRNA expression in rhesus macaque brain during aging
中文题目 circRNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用
期刊名 Cell Discovery IF:4.46
合作单位 中科院昆明动物所
发表时间 2018年9月18日
实验材料 中国猕猴
为了研究circRNA在哺乳动物,尤其是灵长目动物大脑中的表达特点,以及重要的调控作用,我们在猕猴的脑组织中进行了系统的circRNA表达特点和功能的研究。
借助于二代测序技术,以及生物信息学分析工具,我们在2个年龄段、2种性别的8个不同脑区的组织中进行了circRNA的定量研究。我们共获得了17050个表达比较稳定的circRNA。通过对circRNA进行差异和聚类分析,我们发现有数百个不同的circRNA会呈现出组织特异性,性别表达的特异性,以及年龄的特异性等。而且发现高龄猕猴中,circRNA的表达会呈现出富集的趋势,而且这些circRNAs会跟其host mRNA的表达呈现一些相关性。
Fig1:猕猴中circRNAs的表达模式。
为了验证我们的发现,我们挑选了2个重要的circRNAs进行验证,发现它们确实跟宿主mRNA在表达上呈现负相关的特性,且随着年龄的增长表达量会升高,暗示这些circRNA可能跟衰老存在一些必然的联系。我们的结果揭示了circRNA表达的变化在大脑衰老的生物学过程中潜在的调控作用。
Fig7:CircCACNA2D1和circCACNA1E与宿主mRNA在表达上呈现负相关 。
References:
1. MemczakS, Jens M, Elefsinioti A, Torti F, Krueger J, Rybak A, Maier L, Mackowiak SD,Gregersen LH, Munschauer M, et al: CircularRNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency. Nature 2013, 495:333-338.
2. JeckWR, Sorrentino JA, Wang K, Slevin MK, Burd CE, Liu J, Marzluff WF, SharplessNE: Circular RNAs are abundant,conserved, and associated with ALU repeats. RNA 2013, 19:141-157.
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