痤疮是一种常见的慢性皮肤病,多因素病因和发病机制。近年来环状RNA (circRNA)被认为通过circRNA-miRNA-mRNA作用网络在许多生物过程和人类疾病中调控基因表达的关键因素。然而,痤疮患者的circRNAs表达仍不清楚。
广州医科大学皮肤病研究所所长张锡宝团队等,在J Eur Acad Dermatol Venereol杂志发表题为:Circular RNA expression profile analysis of severe acne by RNA‐seq and bioinformatics。本研究首次发现了circRNA在严重的痤疮患者中有差异表达,提示circRNAs可作为痤疮药物靶标的潜在生物标志物。
通过高通量RNA测序技术和生物信息学分析,检测出严重痤疮患者三对病灶皮肤及邻近非病灶性皮肤的环状RNA的表达谱。通过PCR、Sanger测序、qRT‐PCR验证候选环状RNA,预测circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络。
在严重痤疮患者中,与邻近的非病灶性皮肤相比,有538个circRNA差异表达,其中271个表达上调,267个表达下调。GO分析和KEGG通路富集分析表明,异常表达的circRNA主要参与炎症反应和免疫反应。5个候选circRNAs (circRNA_0084927, circRNA_0001073, circRNA_0005941, circRNA_0086376, and circRNA_0018168)在严重痤疮患者中显著性降低),与RNA‐Seq数据分析结果一致。预计这5个circRNA与213个miRNA有相互作用并调控靶基因表达。
与严重痤疮相关的前5个circRNA,及其靶向的miRNA
作者:BioWorld(微信公众号)
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