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  • 循环RNA(circRNA)形成于1991年有幸的发现  
  • 新一代测序揭示circRNA是无处不在
  • circRNA可以作为微RNA“海绵”来调节基因表达

有一些简单的诱惑和好奇,有关圈子,这是在没有开始或结束独特的,不同于其他的东西。在一个不太哲学层次,想着圈分别联想到从我的青春的日子美味的甜甜圈和几何定义去附近的面包店不一致的回忆和努力记笔记在我高中的几何课。

 

甜甜圈

 

话虽如此,你现在可能会明白为什么我被迷住了,当我最近读到环状RNA(circRNA)的存在。更重要的是,我已经结束,为什么大自然会想RNA以这种方式发展,在几乎所有其他真核生物RNA(和DNA)的线性立即疑惑?

我决定研究好奇地向circRNA学习回答了这个困惑,并在这样做中发现了丰富有趣的分子生物学,其中大部分是blogworthy。由于缺乏空间,在这里我已经选择并制作成片段一些认定,是最有趣的,至少对我来说的。

circRNA的偶然发现

我总是对科学感兴趣的开创性发现问题,并研究这个的时候circRNA,我了解到,这些好奇分子的“生物”首次报道于1979年在一篇题为由许与可口可乐普拉多斯电子显微镜证据圆在真核细胞的细胞质RNA的形式。我花了大量时间试图从该出版物的形象,但没有成功。但是,我能找到一个类似的图像公布松本等人于1990年。对于单链circRNA来自酵母,如下所示。松本指出,他们需要强大的变性条件破坏这种分子的广泛分子的氢键。

从酵母〜3000-NT圆形20S RNA的电子显微镜照片。 从Matsumoto等人服用。 (1990)美国国家科学院院刊。 

从酵母〜3000-NT圆形20S RNA的电子显微镜照片。从Matsumoto等人服用。(1990)美国国家科学院院刊。

有趣的是,一年后,在1991年,尤伯杯著名贝尔特·福格尔斯泰因和他的同事意外地发现,在只升/ L000“炒成绩单”目前他们正在研究的候选抑癌基因的正常剪接线性成绩单的浓度。他们提出了形成这些稀有的机制,炒,或参与circRNA的一代“异常拼接成绩单”。这种“偶然发现”,因为他们描述的那样,从而为如何发生RNA函证间接证据。但他们只生物化学或功能性RNA的新物种罕见的失误与进化的目的是什么?

答案,根据审核通过曲等,是到2010年少数circRNAs被发现,研成circRNA生源是最小的。然而,随着高通量测序技术和计算分析的发展,数千circRNAs已经对面简单古细菌物种发现(单细胞微生物没有核),以高复杂人类。事实上,一些circRNAs的表达是> 10倍比相同的基因的它们的规范线性转录物的更高!

我会从试图因为有相当多的circRNA的生源目前已知或建议的机制来避免总结,而不是简单的没有很多的专业术语来描述,所以请曲等。如果你有兴趣。

circRNA的生物学功能

'海绵'的小分子RNA:  值得注意的是,自然的第一个令人信服的功能分析表示circRNA没有报告,直到2013年,当汉森等人在丹麦古老的这样做自然杂志上。根据这些研究者,微RNA(miRNA),基因表达的调节,可通过miRNA的“海绵”在正式类似于如何合成的方式转录物的存在的影响的反义修饰寡核苷酸是用于靶向的miRNA(又名拮抗)。

它们表明,circRNA,他们先前已确定为在人类和小鼠脑被高度表达,充当一个特定微小RNA(MIR),即海绵的miR-7 。他们命名为圆形成绩单的CIR-7(圆形为RNA的miR-7海绵)。海绵暗喻是鉴于中肯即CIRS -7-包含超过70靶(即,结合)位点,如下面所描述。

 

从arraystar.com取

从arraystar.com取

此外,CIRS -7-强烈地抑制的miR-7活性,导致增加的miR-7的目标水平。在小鼠脑,他们观察到重叠的CIR-7和miR-7的共表达,尤其是在新皮质和海马神经元,表明他们的高度内源性的相互作用。

选择性剪接或转录调控:  见曲等。了解详情。

父母基因的表达调控:  见曲等。了解详情。

参与发生和癌的恶性:审查赵和沉在2015年,他们认为现时对circRNAs在多种癌症的特殊作用,在调节癌症通过的miR-7的生物学行为(见上文)或的miR-138调节。此外,circRNA,其基因沉默能力一起,也发挥作用的RNA干扰通过结合靶RNA的,它提供了在癌症治疗中的新的立体(RNAi)的治疗。

最后,我希望你发现circRNA是和我一样好奇地迷人。我鼓励大家分享你的想法,因为这里的意见。

后记

为完整起见,并避免被误导,有丰富的上的信息不同类型和circRNA的功能,以及圆形外DNA,它是在原核生物中常见,但在真核生物中类型的限制,尤其是线粒体DNA。

从rna-seqblog.com取

从rna-seqblog.com取

我以前的博客文章关于高中学生的PCR实验类似的正在开展的国际空间站,最近我读到关于谁是公认的,涉及到以前具有博士或交相关的知识水平,一个科学项目的另一个mindboggling高中生-doctoral教育。马修·鲍尔,在戴维森学院的大二学生,获得了第49届西部内华达区域科学与工程大奖赛,他的项目名为从RNA测序数据量化各位RNA的水平。 他的项目是在此说明的链接,这也提供了一个视频剪辑。荣誉给马修!

原文链接:http://zon.trilinkbiotech.com/2016/05/17/curiously-circular-rna/

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