作者：永诺生物

1、慢性乙型肝炎肝脏circRNA的表达谱

Differential expression profile of hepatic circular RNAs in chronic hepatitis B

期刊：Journal of viral hepatitis

影响因子：4.122

作者单位：云南省第二人民医院

文章简介

circRNA通过对靶miRNA的吸附，发挥基因调控作用，在疾病的发生和发展过程中起着至关重要的作用。但人们对circRNA在慢性乙型肝炎(CHB)中的表达、调控和生物学功能知之甚少。为了找到与CHB相关的肝circRNA，作者使用未经治疗的CHB患者和对照组的肝脏活组织切片进行RNA测序。然后，作者通过生信分析识别与CHB相关的circRNA，建立了circRNA-miRNA-mRNA通路，并采用QPCR验证这些结果。与对照组相比，CHB的肝脏circRNA表达谱有显著差异，其中有99个失调的circRNA与CHB相关。通过对circRNA-miRNA-mRNA通路的分析，作者发现差异表达的肝circRNA靶miRNA有665个。有趣的是，预测的与CHB相关的circRNA-miRNA-mRNA通路中有4个参与HBV感染的发病机制和HBV相关肝病的进展。基因表达的回归分析显示，在这些通路中hsa_circ_0000650与TGFB2之间存在很强的正相关关系，hsa_circ_0000650与miR-6873-3p之间存在负相关关系，提示hsa_circ_00000000650与miR-6873-3p介导的TGFB2相互作用。本研究首先表明，CHB患者的肝circRNA表达谱以及circRNA/miRNA相互作用的情况。因此，circRNA有望成为CHB发生发展的新机制。

2、CircIBTK通过miR-29b抑制系统性红斑狼疮外周血单核细胞DNA去甲基化和AKT信号通路激活

CircIBTK inhibits DNA demethylation and activation of AKT signaling pathway via miR-29b in peripheral blood mononuclear cells in systemic lupus erythematosus

期刊：Arthritis research & therapy

影响因子：4.121

作者单位：上海交通大学医学院

文章简介

背景：系统性红斑狼疮(SLE)是一种慢性、不可治愈的自身免疫性疾病，涉及淋巴细胞功能障碍。circRNA是一种非编码RNA (ncRNA)，具有共价闭环结构，在各种人类疾病中表达异常，可能参与发病机制，需要在SLE中进一步研究。本研究旨在寻找SLE中表达异常的circRNA，探讨circRNA在SLE中的作用。

方法：采用CircRNA测序法检测异常表达的CircRNA，采用QPCR检测表达。相关性分析研究SLE患者circIBTK或miR-29b与临床病理变量之间的相关性。采用细胞培养、核质分离、QPCR、转染、荧光素酶报告检测、western blot分析、DNA提取、甲基化分析等方法研究circIBTK和miR-29b在SLE进展中的作用；使用SPSS 18.0软件进行统计。

结果：作者发现SLE患者中circIBTK表达下调，与系统性红斑狼疮疾病活动度指数(SLEDAI)评分、dsDNA、补体C3水平相关。SLE中miR-29b表达上调，与SLE患者的SLEDAI评分、anti-dsDNA和补体C3水平相关。机制研究表明，miR-29b可诱导DNA去甲基化并激活AKT信号通路，circIBTK通过与miR-29b结合逆转miR-29b诱导的DNA去甲基化和AKT信号通路活化。

结论：CircIBTK在SLE中下调，可能通过与miR-29b结合调节DNA去甲基化和AKT信号通路。CircIBTK和miR-29也可以作为SLE的生物标志物和治疗靶点。

3、对lncRNA的重新分析和circRNA的预测揭示了它们在感染TYLCV的番茄中的新作用

Re-analysis of long non-coding RNAs and prediction of circRNAs reveal their novel roles in susceptible tomato following TYLCV infection

期刊：BMC plant biology

影响因子：3.964

作者单位：江苏农业科学院

文章简介

背景：众所周知，lncRNA参与了一些生物过程，但它们在植物-病毒相互作用中的作用仍未被探索。虽然circRNA已经在动物中被研究过，但在植物系统中，特别是在番茄与番茄黄叶卷曲病毒(TYLCV)的相互作用中，还没有对其进行广泛的研究。

结果：在本研究中，作者采用去除rRNA建库对易感番茄株JS-CT-9210(感染了TYLCV或未经干预的)的RNA转录本进行了测序。共获得了2056个lncRNA，包括1767个基因间长非编码RNA (lincRNA)和289个长非编码天然反义转录本(lncNAT)。对照组与感染组的lncRNA表达情况相似。分析表明，lncRNA可能在多种功能中发挥作用，包括植物激素信号、内质网中的蛋白质加工、RNA运输、核糖体功能、光合作用、糖苷代谢和植物-病原体相互作用。利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)分析，作者发现lncRNA S-slylnc0957的表达降低导致了番茄植株对TYLCV的抗性增强。此外，作者使用CircRNA Identifier (CIRI)软件识别184种circRNA候选体，其中32种circRNA在对照组中特异性表达，83种circRNA在TYLCV样本中特异性表达。大约62%的circRNA来自外显子。作者通过PCR和Sanger测序验证了circRNA的存在，发现大部分circRNA来源于蛋白编码基因的外显子。这些circRNA亲本基因的沉默导致TYLCV病毒积累减少。

结论：在本研究中，作者使用生物信息学方法鉴定了新型的lncRNA和circRNA，并证明这些RNA作为TYLCV感染的负调控因子发挥作用。此外，感病番茄植株中lncRNA的表达方式与耐药番茄植株不同，而外显子circRNA的表达与各自的蛋白编码基因正相关。本研究为阐明lncRNA和circRNA在易感番茄感染TYLCV中的新作用提供了研究基础。

4、circRNA表达谱显示hsa_circ_0128298是肝癌诊断和预后的生物标志物

Screening differential circular RNA expression profiles reveal that hsa_circ_0128298 is a biomarker in the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma

期刊：Cancer management and research

影响因子：3.851

作者单位：山东大学附属山东肿瘤医院

文章简介

目的：本研究的目的是分析circRNA hsa_circ_0128298在肝癌(HCC)中的诊断和预后价值。

患者及方法：采用circRNA芯片检测三对肝癌患者的肿瘤及非癌组织的circRNA表达。结果显示，三对癌组织和癌旁组织中有两种circRNA表达具有差异，并用QPCR验证结果。此外，进一步分析hsa_circ_0128298表达水平与HCC患者临床病理特征的关系；通过ROC曲线分析确定其临床诊断价值；使用Cox回归模型确定患者预后的独立预后因素；采用Kaplan-Meier方法对生存数据进行分析，用对数秩检验方法对差异进行评价。

结果：hsa_circ_0128298在肝癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织；其ROC曲线下面积为0.668，可作为诊断因子；敏感性和特异性分别为0.716和0.815。AFP和hsa_circ_0128298表达水平是独立的预后因素。hsa_circ_0128298低表达的患者总生存率明显高于hsa_circ_0128298高表达的患者。

结论：hsa_circ_0128298可促进肝癌的增殖和转移，有望成为肝癌患者新的诊断和预后生物标志物。然而，需要更大的样本量来证实我们的结论。

5、Hsa_circ_0046264通过靶向hsa-miR-1245上调BRCA2从而抑制肺癌

Hsa_circ_0046264 up-regulated BRCA2 to suppress lung cancer through targeting hsa-miR-1245

期刊：Respiratory research

影响因子：3.841

作者单位：昆明医学院附属甘美医院

文章简介

目的：肺癌在世界范围内的死亡人数呈上升趋势。基因芯片帮助人类进一步了解基因并识别新的circRNA。本研究旨在探讨hsa_circ_0046264在肺癌中的生物学功能和分子机制，对肺癌的早期诊断和临床治疗有一定的帮助。

方法：通过生物信息学分析筛选出差异基因hsa_circ_0046264及其下游基因，并通过荧光素酶报告试验进行验证。用QPCR和Western blot分别检测RNA和蛋白水平。RNase R消化证实了circRNA的存在。采用MTT法、流式细胞术和DNA损伤法测定细胞活力、侵袭和凋亡。裸鼠肿瘤的形成和免疫组化证实了hsa_circ_0046264在体内的作用。

结果：Hsa_circ_0046264和BRCA2在肺癌组织中下调，miR-1245上调。Hsa_circ_0046264通过靶向miR-1245上调BRCA2诱导细胞凋亡，抑制肺癌细胞的增殖和侵袭。Hsa_circ_0046264抑制体内肿瘤生长。

结论：Hsa_circ_0046264是肺癌的抑癌基因。hsa_circ_0046264的过表达可下调miR-1245从而上调BRCA2表达。

6、circRNA通过海绵结合miR-203促进鸡的成肌细胞的增殖和分化

Circular RNA circSVIL Promotes Myoblast Proliferation and Differentiation by Sponging miR-203 in Chicken

期刊：Frontiers in genetics

影响因子：3.789

作者单位：华南农业大学

文章简介

circRNA在各种真核生物中广泛表达，参与动物的生长发育。作者之前对circRNA测序的研究显示，circSVIL是一种外源性circRNA，在11胚龄(E11)、16胚龄(E16)和孵化后1天(P1)骨骼肌间具有表达差异。在本研究目的是研究circSVIL对骨骼肌发育的影响。作者检测了在E10到P1期间胚胎腿部肌肉中circSVIL的表达水平，发现在骨骼肌的胚胎后期发育过程中，circSVIL有较高的表达水平。通过双荧光素酶检测、RNA免疫沉淀和生物素偶联miRNA pull down实验，作者发现circSVIL可以作为miR-203海绵发挥作用，上调c-JUN和MEF2C的mRNA水平。circSVIL可以促进鸡的成肌细胞的增殖和分化，拮抗miR-203的功能。总的来说，数据表明circSVIL通过隔离miR-203来促进鸡胚胎骨骼肌的发育。

7、circ-PRKCI的下调可抑制靶向PLCB1的miR-1324的表达，从而抑制先天性巨结肠症的细胞迁移和增殖

Down-regulation of circ-PRKCI inhibits cell migration and proliferation in Hirschsprung disease by suppressing the expression of miR-1324 target PLCB1

期刊：Cell cycle

影响因子：3.53

作者单位：南京医科大学儿童医院

文章简介

circRNA是一种新型的非编码RNA (ncRNA)，已被证明参与细胞内RNA调控网络，在许多病理过程中发挥重要作用。最近，有报道称circ-PRKCI可调节多种人类癌症的细胞增殖、迁移和侵袭。先天性巨结肠症(HSCR)是一种众所周知的先天性肠道运动障碍，其根源在于颅尾神经嵴细胞迁移异常。本研究探讨circ-PRKCI是否会影响HSCR细胞的迁移和增殖。采用QPCR检测48例HSCR无神经节细胞组织和48例正常肠组织中circ-PRKCI的表达。荧光素酶报告试验和RNA免疫沉淀(RIP)试验验证了miR-1324与PLCB1或circ-PRKCI之间的直接相互作用。分别采用CCK-8、EdU和transwell来评价miR-1324或circ-PRKCI对细胞增殖潜能和的迁移能力影响。circ-PRKCI在HSCR无神经节细胞组织中显著下调。更重要的是，circ-PRKCI的下调抑制了细胞的增殖和迁移。机制研究证实circ-PRKCI作为miR-1324的分子海绵上调PLCB1的表达。综上所述，本研究揭示了circ-PRKCI-miR-1324-PLCB1调控网络在HSCR中的重要作用，为HSCR的发病机制提供了新的认识。