原创作者：永诺生物|微信公众号

1、circRNA在人造血细胞中的表达广泛且具有细胞特异性

Circular RNA expression in human hematopoietic cells is widespread and cell-type specific

期刊：Nucleic Acids Res

影响因子：11.561

作者单位：荷兰阿姆斯特丹大学

文章简介

造血干细胞可分化为多种特殊的血细胞。这一过程受到严格的调控，依赖于转录因子、miRNA和lncRNA。最近，也发现circRNA可以调节细胞进程。然而，他们的表达模式和特性仍未清楚。在此，作者首次全面分析circRNA在人类造血祖细胞、分化淋巴细胞和髓细胞中的表达。作者发现circRNA的表达具有细胞型特异性的，而且在细胞成熟后会表达增加。circRNA剪接变体也可以是特定于细胞类型的。此外，有核造血细胞含有circRNA，其表达水平高于相应的线性RNA。去核血细胞，即血小板和红细胞，可能使用RNA来维持其功能，对环境因素作出反应或通过微泡向其他细胞传递信号。在所有造血细胞中，血小板和红细胞的circRNA数量最多，而circRNA的类型和数量在成熟过程中发生了变化。circRNA在造血细胞中的这种细胞型特异性表达模式提示其在分化和细胞功能方面的作用尚不为人所知。

2、circRNA在癌症中的新功能和潜在诊断价值

Emerging function and potential diagnostic value of circular RNAs in cancer

期刊：Molecular cancer

影响因子：7.776

作者单位：青岛大学

文章简介

circRNA作为一种新型的内源性RNA，具有共价闭合的连续环路，既没有5'端及 3'端，也没有poly(A)尾。许多circRNA具有丰富、稳定、保守和组织/发育阶段特异性表达的特征。此外，circRNA在肿瘤发生和转移过程中发挥着重要作用，如充当ceRNA或miRNA海绵，与蛋白质相互作用并编码蛋白质。越来越多的证据表明，它可能作为癌症诊断所需的新的生物标志物。本文综述了circRNA作为一种潜在的生物标志物的最新研究进展，包括circRNA的分类和生物发生、机制和功能，以及circRNA在不同癌症中的应用。

3、芯片分析证实hsa_circ_0064428是肝细胞癌的一种潜在的免疫相关预后生物标志物
Global microarray profiling identified hsa_circ_0064428 as a potential immune-associated prognosis biomarker for hepatocellular carcinoma

期刊：J Med Genet

影响因子：5.751

作者单位：浙江丽水中心医院

文章简介

背景：越来越多的证据表明circRNA参与肝细胞癌(HCC)的肿瘤发生和转移；然而，其在HCC中的作用研究进展相对缓慢。本文中作者研究血浆circRNA是否能反映肝癌肿瘤组织中的肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)，并作为肝癌预后的生物标志物。

方法：作者对HCC患者的组织标本进行CD8免疫组化染色，检测其TILs；然后，通过芯片研究高TILs和低TILs的HCC患者血浆中circRNA的表达谱，并通过qRT-PCR验证差异表达的circRNA；采用SPSS软件和GraphPad Prism进行统计分析。

结果：作者已经证实高TILs的HCC患者总体生存率显著提高，提示TILs可以预测临床结果。高TILs和低TILs的HCC患者血浆间的circRNA芯片成功鉴定出6个差异表达的新型circRNA。其中，hsa_circ_0064428在高TILs患者中表达明显降低，而在低TILs患者中表达增加。hsa_circ_0064428与患者生存、肿瘤大小、转移呈负相关。

结论：这些结果提示hsa_circ_0064428可能是一种潜在的HCC预后生物标志物。为了进一步阐明hsa_circ_0064428在HCC肿瘤发生和转移中的作用，还需要进一步的深入研究。

4、心血管疾病中的circRNA
The emerging landscape of circular RNA in cardiovascular diseases

期刊：J Mol Cell Cardiol

影响因子：5.296

作者单位：广东医科大学

文章简介

circRNA是一种大型的新型内源性转录本，已成为RNA生物学领域的一个新的研究热点。circRNA主要由外显子或内含子通过多种机制产生，大多数circRNA在不同物种间是稳定且保守的。最近的研究表明，circRNA可以作为miRNA海绵、蛋白质的结合伙伴、转录调控因子，甚至可以被翻译成蛋白质。越来越多的证据表明，circRNA在细胞增殖、凋亡和衰老等多种生物过程中发挥重要作用，并可能作为各种心血管疾病的潜在诊断生物标志物或治疗靶点。本文综述了circRNA的生物发生、性质和生物学功能，并对其在心血管疾病中的作用进行了综述。

5、Circ-ZEB1.33通过海绵miR-200a-3p和上调CDK6促进人肝癌的增殖
Circ-ZEB1.33 promotes the proliferation of human HCC by sponging miR-200a-3p and upregulating CDK6

期刊：Cancer Cell Int

影响因子：3.96

作者单位：镇江市第三人民医院

文章简介

背景：数据表明circRNA在肿瘤的许多生物学过程中发挥着重要的调控作用，本研究旨在探讨circ-ZEB1.33-miR-200a-3p-CDK6调控轴在人肝癌(HCC)中的作用。

方法：利用在线工具circNet预测调节轴，验证circ-ZEB1.33-miR-200a-3p-CDK6在人肝癌中的表达及相关性。采用临床资料对肿瘤及血清circ-ZEB1.33的诊断价值进行了评估。通过体外研究探讨circ-ZEB1.33-miR-200a-3p-CDK6在调节细胞周期中的作用。

结果：circ-ZEB1.33、CDK6过表达、miR-200a-3p下调，circ-ZEB1.33与miR-200a-3p呈负相关，circ-ZEB1.33与CDK6呈正相关。组织和血清circ-ZEB1.33与HCC患者不同的TMN分期及预后有关。RNA pull-down实验表明circ-ZEB1.33可以通过海绵miR-200a-3p来减少miR-200a-3p，荧光素酶报告基因实验表明miR-200a-3p可以通过靶向其3'UTR下调CDK6转录。体外实验表明，circ-ZEB1.33可以通过增加CDK6/Rb调控的S期比例促进HCC细胞增殖。

结论： circ-ZEB1.33-miR-200a-3p-CDK6调节轴的增殖促进作用在人肝癌中存在并得到验证，肿瘤和血清circ-ZEB1.33均可作为HCC患者预后的指标。

6、circ-VANGL1是一种竞争性内源性RNA，通过调控miR-605-3p/VANGL1通路参与膀胱癌的进展

Circular RNA circ-VANGL1 as a competing endogenous RNA contributes to bladder cancer progression by regulating miR-605-3p/VANGL1 pathway

期刊：J Cell Physiol

影响因子：3.923

作者单位：南昌大学第二附属医院

文章简介

越来越多的报道表明，circRNA在包括癌症在内的人类疾病中是非常重要的调控因子。在膀胱癌(BC)中，有报道称有几种circRNA参与肿瘤的进展，如circ-ITCH和circTCF25。然而，在BC中大部分circRNA的功能仍然是未知的。在这项研究中，作者通过生物信息学分析确定了一种新的circRNA称为circ-VANGL1。作者发现circ-VANGL1在BC组织中比相邻正常组织高表达。此外，作者还发现circ-VANGL1可以作为BC患者的预后标志物。通过功能实验，作者发现circ-VANGL1敲低可以显著抑制体外的BC细胞增殖、细胞周期、迁移和侵袭。此外，circ-VANGL1沉默抑制了BC细胞在体内的增殖。机制研究表明circ-VANGL1是miR-605-3p的海绵，靶向于BC细胞中的VANGL1。circ-VANGL1通过抑制miR-605-3p的有效性，导致VANGL1表达，从而导致BC细胞的增殖、迁移和侵袭。综上所述，研究表明circ-VANGL1/miR-605-3p/VANGL1是参与BC进展的一种新的基本信号通路。

7、全面分析整个编码和非编码RNA转录组表达谱，构建circRNA-lncRNA共调控的ceRNA网络

Comprehensive analysis of the whole coding and non-coding RNA transcriptome expression profiles and construction of the circRNA-lncRNA co-regulated ceRNA network in laryngeal squamous cell carcinoma

期刊：Funct Integr Genomics

影响因子：3.889

作者单位：哈尔滨医科大学第二附属医院

文章简介

最近，越来越多的证据表明，非编码RNA (ncRNA)在致癌性中起着至关重要的作用。然而，特别是对lncRNA和circRNA的调控机制和功能仍知之甚少。在本研究中，作者首次通过芯片同时检测了5对喉鳞癌(LSCC)和匹配的非癌组织中包括miRNA、circRNA和lncRNA + mRNA在内的整个转录组的表达谱。选择5个失调的miRNA、4个circRNA、3个lncRNA和5个mRNA，通过实时定量PCR (qRT-PCR)对20对LSCC样品进行验证。作者分别构建了LSCC相关的lncRNA及circRNA (circRNA或lncRNA-miRNA-mRNA)ceRNA网络。功能注释显示lncRNA介导的ceRNA网络被富集于参与肿瘤相关通路的基因。Hsa_circ_0033988在circRNA介导的ceRNA网络中含量最高，与脂肪酸降解有关，脂肪酸降解导致肿瘤相关恶病质中脂肪的消耗。最后，为了明确ncRNA的协同调控机制，作者整合上述两个网络构建了一个circRNA-lncRNA的协同调控网络，并识别出9个模块进行进一步研究。提取模块2中miRNA失调最严重的子网络，建立ncRNA参与的TGF-beta相关通路。综上所述，研究结果提供了编码和非编码RNA的高通量芯片数据，为进一步研究LSCC中ncRNA的ceRNA调控机制奠定了基础。

原文：20180831 | circRNA研究最近有哪些新进展？