原创作者：水成文 |上海冷泉生物科技有限公司 微信公众号

外泌体（exosome）是由大多数细胞都可以分泌的纳米级的内吞囊泡，含有多种活性分子，如蛋白质、脂肪、RNA（如mRNA、miRNA、LncRNA、circRNA等），可以调节受体细胞的行为，并可作为疾病的循环生物标志物。

1983年，外泌体被人类发现，当时被认为是是细胞废弃物而未受关注，2013年，诺贝尔生理学或医学奖授予了在细胞内囊泡（外泌体）运输调控机制领域作出重要贡献的三位科学家，将外泌体相关研究的热度推向高潮。由于在临床上的巨大应用价值，近几年外泌体成为科研热点，相关论文发表数量呈爆炸式增长，2017年外泌体相关SCI论文多大2000篇，2018年仅上半年相关SCI论文就达到近1500篇。

外泌体在肿瘤诊断、肿瘤转移、生物标志物、药物载体等多个领域取得了许多突破性进展，近日，瑞士制药巨头罗氏（Roche）与PureTech Health签下基于乳源外泌体平台技术的合约，金额高达10亿美元。

外泌体不管是在基础科研、临床应用，还是商业研发，都相当火热，BioWorld此次介绍一个非常好用的外泌体数据库：exoRBase，人类血液外泌体的RNA-seq数据分析的circRNA、LncRNA和mRNA的存储库，还包括已发表文献的实验验证。exoRBase对标准化RNA-seq数据的RNA表达谱进行了整合和可视化，数据涵盖了正常个体和不同疾病患者。数据库网址：http://www.exoRBase.org，网页打开如下图。

数据库网站截图

exoRBase数据库收集和描述人类血液外泌体中所有长的RNA，目前包含58330个circRNA、15501个LncRNA和18333个mRNA，提供了注释、表达水平和可能的来源组织，数据库将定期更新，提供更多的外泌体RNA信息。

数据库收录的样本包括健康对照者32例，冠状动脉心脏疾病（CHD）6例，结肠癌（CRC）12例，肝细胞癌（HCC）21例，胰腺腺癌（PAAD）14例，乳腺癌2例。所有收集到的数据都经过相同的预处理。除此之外，还分析了LncRNA和mRNA在人类组织中的组织特异性，以及circRNA的来源等。每种疾病所对应的各种RNA分子数目如下表：

数据库提供了多种检索途径，可分别检索circRNA和LncRNA或mRNA，还可以通过标本类型、基因类型、组织表达特异性信息等检索选项进行有针对性的检索。

exoRBase数据库概览

数据检索单个基因的界面中可以呈现基因的折线图、热图、基因的概要信息、框图及详细描述等等。

该数据库由复旦大学上海肿瘤研究所黄胜林研究员团队于2018年1月发表在Nucleic Acids Research杂志，文章题为：exoRBase: a database of circRNA, lncRNA and mRNA in human blood exosomes（下图）。

exoRBase数据库为外泌体研究提供了非常好用的查询平台，数据库还提供了数据下载和上传接口，给外泌体领域的研究带来很大的便利。